Jelmer vertelt het historische verhaal van de kruistocht naar Damiate (1214-1218) door de ogen van Jelmer van Bedum. Jelmer begint zijn reis vol overtuiging, maar gaandeweg krijgt hij steeds meer twijfels over de expeditie. Op 24 augustus 1218 veroveren de kruisvaarders de Kettingtoren van Damiate. Jelmer en zijn mannen spelen hierbij een beslissende rol. Jelmer is niet alleen een spannend avonturenverhaal, maar ook een verhaal met meerdere lagen. Scenarist Josse Pietersma: "Het gaat om de innerlijke strijd van Jelmer. Hij begint te twijfelen aan de rechtmatigheid van de kruistocht, maar de mensen om hem heen zien in Jelmer juist een uitverkorene die de aanval moet gaan leiden. Jelmer worstelt met heel menselijke vragen: Waar geloof ik in? Waar wil ik voor vechten? En hoe verhoudt mijn overtuiging zich tot het belang van anderen?"